Cовсем останавливается или замедлается? Может материнка смотрит свой датчик температуры, и решает, что дополнительное охлаждение ей не нужно, температура в норме, вот и тормозит его?...
Может, если ты очень хочешь, чтоб он всегда крутился, отключить в биосе режим интеллектуального регулирования частоты вращения?