А кто не разрешает создать отдельней раздел в линуксе?! буть он нтфс или екст4, не обязательно его монтировать в какую то папку, можно оставить просто как раздел.
А насчет структуры папок, мне ето кажется удобным. К примеру, в виндовс на диске Ц:\ формируется куча папок под разного рода файлы (видео, аудио, документы) никто ними никогда не пользуется ибо знает слетит винда, вирусу = форматну Ц: все на х℗ен.. Другое дело тут, вмонтировал второй раздел в папку хом, все под рукой в одном месте и не страшно..! Я не хочу никого переубедить что лучше, просто высказал свое мнение
а что вайном не пашет? тогда в виртуальную машину их)))